È stato pubblicato nella Gazzetta Ufficiale n. 273 del 23 novembre 2009 il Decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri che istituisce il registro dei Gruppi europei di cooperazione territoriale - G.E.C.T. Il registro è tenuto dal Dipartimento per gli Affari regionali della Presidenza del Consiglio dei Ministri, che provvede ai conseguenti adempimenti.
Le attività istruttorie relative alla costituzione ed alla partecipazione ad un Gruppo europeo di cooperazione territoriale - G.E.C.T., previste dal regolamento CE n. 1082/2006 e dagli articoli 46 e 47 della legge 7 luglio 2009, n. 88, sono altresì attribuite al Dipartimento per gli affari regionali della Presidenza del Consiglio dei Ministri.
Il Dipartimento per gli affari regionali opera, comunque, nell'ambito del Segretariato generale, anche nel caso in cui l'esercizio delle funzioni in materia di rapporti con le regioni, di cui agli articoli 2, comma 2, lettera d) e 4 del decreto legislativo n. 303/1999, sia delegato dal Presidente dei Consiglio dei Ministri ad un Ministro o Sottosegretario di Stato.